Ja, selvfølgelig kan de køre på dit bundkort hvis du har en SATA controller. Markant forskel, både ja og nej. SATA kan teoretisk overføre 150mb/s, mens IDE(PATA) harddiske topper på 133mb/s. Med mindre du smider SATA eller IDE i RAID, så kan du ikke mærke forskel. Tør dog ikke at sige om SATA harddiske generelt er hurtigere end IDE harddiske i RAID, men jeg vil da tro det. Der er masser af tests på nettet der omhandler IDE vs. SATA, læs dem.
Kablerne til SATA harddiske er meget mindre end dem til IDE, og det er en fordel hvis du har du pladsbesparende krav.
Jeg vil da anbefale dig at gå efter en Raptor disk hvis du går efter hastighed...