Jeg synes egentlig svaret er mere simpelt end spørgsmålet... ;)
AGP er i dag fuldt konkurrencedygtigt med PCIe, så har man ikke planer om at opgradere bundkort sammen med grafikkortet, så er et AGP kort den rigtige løsning. Er man ved at udskifte hele systemet, så kan man lige så godt købe et bundkort med PCIe og dermed et PCIe grafikkort.
Og AGP er en uddøende race - der kommer bare til at gå mange år, før man ikke kan få AGP kort mere. Om 2-3 år vil man sikkert også begynde at se en ydelsesmæssig forskel på AGP og PCIe, når den nuværende AGP bus bliver sat under pres. Men i dag er der ikke nogen forskel.