karaffa
#0
hejsa jeg står i en situation hvor jeg skal samle en computer der skal udføre molekyle dynamik simulationer, så jeg skal bruge masser af rå regne kraft. Budgetet er på max 20000
Jeg har ikke den største erfaring med den type computere så håber på lidt hjælp 8)
Jeg har ikke den største erfaring med den type computere så håber på lidt hjælp 8)
#1
:e lyder fint... men mon ikke det er at par opteron der skal til den slags... Eller en Dualcore X2'er. Mon ikke X2'eren vil være at foretrække, da den er klart billigst, og yde-evnen er tæt på at være den samme. Men heller ikke min stærke side. Kunne bare forestille mig noget server-agtigt!
#2
Det afhænger vel lidt af hvad programmet der skal køre på den er med på.
Er programmet multithreaded? Er det optimeret til en specifik CPU arkitektur? osv...
Men en ordenlig bunke RAM er nok ikke en dårlig ide. Kunne godt forstille mig at udregning af væskedynamik kan producer nogle meget store dataset, som jo helst skulle kunne tligåes hurtigts muligt.
Er programmet multithreaded? Er det optimeret til en specifik CPU arkitektur? osv...
Men en ordenlig bunke RAM er nok ikke en dårlig ide. Kunne godt forstille mig at udregning af væskedynamik kan producer nogle meget store dataset, som jo helst skulle kunne tligåes hurtigts muligt.
#3
Jeg overvejede også enten en X2 eller måske 2 Xeon, men der er jo en anselig pris forskel, men er slet ikke sikker på ydelses forskellen.
Jeg er ved at undersøge om programmerne, hovedsagligt Fedora, evt er optimeret til enten pentium eller amd.
Men de skal køre under Linux.
Jeg er ved at undersøge om programmerne, hovedsagligt Fedora, evt er optimeret til enten pentium eller amd.
Men de skal køre under Linux.
under linux...
så tror jeg Intel er bedst. Men kan godt være jeg tager fejl.
så ville jeg tage en pentium D 840. dual core med HT. :)
så tror jeg Intel er bedst. Men kan godt være jeg tager fejl.
så ville jeg tage en pentium D 840. dual core med HT. :)
#5
fra Fedora hp :
Fedora Core is available for x86-64, i386, and ppc/ppc64
Fedora Core is available for x86-64, i386, and ppc/ppc64
#6
#3: du kan jo også evt. tjekke om de kan finde ud af 64bit. Men ved at Opteron efterhånden er den foretrukne processor til den slags hardcore simulator-beregninger. Mest derfor jeg tænkte AMD.
#7
#8
4# Der er ikke rigtig nogen forskel om du bruger Intel eller AMD til linux, personligt vil jeg foretrække Debian istedet for Fedora
#9
#7: sejt system dér..... Lige før jeg kunne finde på at give penge for det. Seriøst najs! :)
#10
9# Mangler kun RAM, Så har jeg de dele :)
#11
#7 lækkert system.
Ved du om Fedora er kompetibelt med Opteron ?
Ved du om Fedora er kompetibelt med Opteron ?
#12
#7 ville en dualcore til 3000 (3800+, 1800Mhz) så ikke være billigere/bedre valg, tænkte mest på at bundkortet ville være noget billigere samt kunne clockes noget højere?
#13
11# Det er den helt bestemt,
12# Det ville være et billiger valg, men jeg holder stadig fast i to cpu konfiguration, og med et loft på 20.000 Kr er det et must
12# Det ville være et billiger valg, men jeg holder stadig fast i to cpu konfiguration, og med et loft på 20.000 Kr er det et must
#14
Okey
Nu jeg tænker mig om så er det faktisk nok 20000 uden moms...
Så ingen bekymringer Århus universitet betaler regningen. :)
Nu jeg tænker mig om så er det faktisk nok 20000 uden moms...
Så ingen bekymringer Århus universitet betaler regningen. :)
#16
#0:
Find lige ud af hvad instruktions-sæt det der molekyle-program er optimeret til. Derfra er det så at finde nogle benchmarks over hvilke cpu'er der yder bedst i sådan en situation.
Find lige ud af hvad instruktions-sæt det der molekyle-program er optimeret til. Derfra er det så at finde nogle benchmarks over hvilke cpu'er der yder bedst i sådan en situation.
#17
#13 tager jeg helt fejl hvis en Dualcore@2Ghz vil yde som Dualcpu@2Ghz i det tilfælde kan jeg ikke helt se pointen i et dualcpu setup medmindre det er for at få dual dualcore :e
#18
17# Det tør jeg ikke sige, Jeg har endnu ikke set en anmeldelse hvor de CPUer var med
#19
#17: ikke helt.... Da X2'erne bruger en fælles memory-controller, har hver opteron deres egen dual-channal-controller. Så opteronen må have en klar fordel, når rammene bliver belastede.
#20
#19 men de har jo stadigvæk noget fælles data, og hvis cpu1 skal bruge noget som cpu0 har gemt, kommer det så ikke til at gå over cpu0's controller (mener jeg at jeg læste)
Nu ved jeg ikke om rammene bruges meget i #0 tilfælde eller hvor meget, men de skal da alligevel være en del før at 2x1,6@2,2 (tror ikke at de er nemme at få højere og det er jo nok ikke det store oc board) er hurtigere end dualcore@2,5, men det er der jo self kun een måde at finde ud af på :00
Nu ved jeg ikke om rammene bruges meget i #0 tilfælde eller hvor meget, men de skal da alligevel være en del før at 2x1,6@2,2 (tror ikke at de er nemme at få højere og det er jo nok ikke det store oc board) er hurtigere end dualcore@2,5, men det er der jo self kun een måde at finde ud af på :00
#21
Prøv at kigge på noget af det her:
http://edbpriser.dk/Listproduc...
Men hvis det endelig skal være klonehardware, vil jeg anbefale dig at kigge på Tyans produkter. Hvorvidt det skal være dual eller single cpu, find ud af om den applikation serveren skal trække kan udnytte det eller ej. Hvis den kan så køb dual-cpu fremfor dualcore. Dermed opnår du mere båndbredde i det samlede system, såfremt du køber Opteron hardware, med Intel er det ligegyldigt, den har ikke sin egen ramkontroller, men skal over FrontSideBussen, som den forøvrigt deler med en evt. processor nummer to. Husk at få et bundkort hvor hver CPU har sine egne ram-sokler, og husk at fylde dem (dog ikke mere end 4 GB hvis du skal køre en 32 bit UNIX på den). Køb den/de hurtigste CPU'er du kan, og glem alt om hyper-threading, SSE osv. Fart(Den reélle, ikke clockfrekvensen) og båndbredde er det der tæller.
Husk at købe min. to diske og køre RAID1 på dem, og tag backup af dyret.
http://edbpriser.dk/Listproduc...
Men hvis det endelig skal være klonehardware, vil jeg anbefale dig at kigge på Tyans produkter. Hvorvidt det skal være dual eller single cpu, find ud af om den applikation serveren skal trække kan udnytte det eller ej. Hvis den kan så køb dual-cpu fremfor dualcore. Dermed opnår du mere båndbredde i det samlede system, såfremt du køber Opteron hardware, med Intel er det ligegyldigt, den har ikke sin egen ramkontroller, men skal over FrontSideBussen, som den forøvrigt deler med en evt. processor nummer to. Husk at få et bundkort hvor hver CPU har sine egne ram-sokler, og husk at fylde dem (dog ikke mere end 4 GB hvis du skal køre en 32 bit UNIX på den). Køb den/de hurtigste CPU'er du kan, og glem alt om hyper-threading, SSE osv. Fart(Den reélle, ikke clockfrekvensen) og båndbredde er det der tæller.
Husk at købe min. to diske og køre RAID1 på dem, og tag backup af dyret.
#22
Jepper regnede også med at lave et RAID 1 setup.
#21
Det med max 4Gb RAM, geælder det også for et Linux system ?
#21
Det med max 4Gb RAM, geælder det også for et Linux system ?
#23
17# Når nu jeg tænker mig om, så har Opteron bundkort noget der hedder NUMA, Det minder meget om dual channel og skulle give en hel del, Så derfor er jeg sikker på at Dual Opteron vil være et bedre valg
21# HP/Compaq... Ustabile lort også betaler du for navnet :)
21# HP/Compaq... Ustabile lort også betaler du for navnet :)
#24
22# Overhovedet ikke, Jeg ved ikke lige hvad 21# snakker om??
#25
#0, når det handler om rå regnekraft, så skal du klart have en AMD med en masse ram.
Enten et dual Opteron setup eller en X2. Umiddelbart ville jeg gå efter et dual Opteron setup, der så senere kan opgraderes med to dualkerne Opteron (i alt 4 cpu'er).
Det vilde bud vil være noget i retning af:
Processor: 2 * AMD Opteron 246 (2 Ghz), Socket 940, BOX 3.598,00
Bundkort: Tyan Thunder K8W S2885ANRF 4.199,00
Ram: 8* Dane-Elec DDR400, 512MB ECC 3.752,00
UPS: APC Smart-UPS 1500, 1500Va 4.255,00
Kabinet: Intel Server Chassis SC5200, 5U Rack (2*650 Watt redundent PSU'er) 6.109,00
I alt inkl. moms: DKK 21.913,00
I alt exkl. moms: DKK 17.530,40
Så skal der bare et par billige SATA diske i raid 1 og et dvd-drev oveni.
En meget billigere løsning er et socket 939 setup med en X2 4800+, nogle almindelige ram (4*1 GB), et mere normalt kabinet uden dobbelt strømforsyning og så også uden UPS. Det kan jo gøres for det halve.
Enten et dual Opteron setup eller en X2. Umiddelbart ville jeg gå efter et dual Opteron setup, der så senere kan opgraderes med to dualkerne Opteron (i alt 4 cpu'er).
Det vilde bud vil være noget i retning af:
Processor: 2 * AMD Opteron 246 (2 Ghz), Socket 940, BOX 3.598,00
Bundkort: Tyan Thunder K8W S2885ANRF 4.199,00
Ram: 8* Dane-Elec DDR400, 512MB ECC 3.752,00
UPS: APC Smart-UPS 1500, 1500Va 4.255,00
Kabinet: Intel Server Chassis SC5200, 5U Rack (2*650 Watt redundent PSU'er) 6.109,00
I alt inkl. moms: DKK 21.913,00
I alt exkl. moms: DKK 17.530,40
Så skal der bare et par billige SATA diske i raid 1 og et dvd-drev oveni.
En meget billigere løsning er et socket 939 setup med en X2 4800+, nogle almindelige ram (4*1 GB), et mere normalt kabinet uden dobbelt strømforsyning og så også uden UPS. Det kan jo gøres for det halve.
#26
Tror ikke en UPS er nødvendig, men hvis de har brug for den, tror jeg de har en på uni som kan bruges ;)
#27
er det til et firma eller bare til dig privat?
for hvis det er til et firma ville jeg købe en færdig pc, fra ibm, hp eller lignende. så er der også garenti på den, og det er ikke dig der får ørene i maskine når noget går i stykker.
#28
25#
Tyan Thunder K8WE hvis vi skal op i den type bundkort
Tyan Thunder K8WE hvis vi skal op i den type bundkort
#29
#28, du har nok ret i, at K8WE er et bedre valg. :r
#30
Tusind tak for alle de gode inputs !!
#31
4GB-ram er et 32bit problem..... 2^32 = 4096MB... athlon64 har en 40bit memory-controler. 2^40 = 1024GB ram
Så bare roligt, der er massere af plads. :e
Memory-controlleren har ikke noget at gøre med processoren. Xeon-processorer har kørt med en udvidet memorycontroller i flere år. Og 2-86 som er en 16bit-processor havde en 32bit ram-controller. 2^16 er ik særligt meget, så man kom uden om problemet på den måde! (64KB på en 16bit ram-controller 🙂
Så bare roligt, der er massere af plads. :e
Memory-controlleren har ikke noget at gøre med processoren. Xeon-processorer har kørt med en udvidet memorycontroller i flere år. Og 2-86 som er en 16bit-processor havde en 32bit ram-controller. 2^16 er ik særligt meget, så man kom uden om problemet på den måde! (64KB på en 16bit ram-controller 🙂
#32
#22 Det gælder for alle 32 bit systemer, sådan et kan max. gabe over 4GB. Der er 32 bit systemer der kan, men det kræver SVJV særligt hardware. 64 bit versionerne kan selvfølgelig godt, men hvis softwaren kun findes i en 32 bit udgave kan det jo være ligegyldigt.
#23 Det må deres hjemmecomputere du taler om, deres servere er noget af det bedste der kan fåes for penge.
#28, #29 Har selv et og det kører fantastisk, men det er vist mere et workstationbundkort end et serverbundkort.
MVH
Morten Strårup
#23 Det må deres hjemmecomputere du taler om, deres servere er noget af det bedste der kan fåes for penge.
#28, #29 Har selv et og det kører fantastisk, men det er vist mere et workstationbundkort end et serverbundkort.
MVH
Morten Strårup
#33
#32, nu er det jo nærmest også en workstation, der skal bygges, hvis den skal bruges til specifikke regneopgaver og ikke at servicere en masse andre computerere... ;)
#34
#33
Nej, som jeg forstår det, er det en maskine der skal stå og snurre i et serverrum, og kun udføre den ene opgave, at beregne de simulationer.
K8WE boardet kan sagtens anvendes, men jeg vil mene at det ville være smartere med et med onboard grafikkort, så der ikke skal investeres i et oven i.
MVH
Morten Strårup
Nej, som jeg forstår det, er det en maskine der skal stå og snurre i et serverrum, og kun udføre den ene opgave, at beregne de simulationer.
K8WE boardet kan sagtens anvendes, men jeg vil mene at det ville være smartere med et med onboard grafikkort, så der ikke skal investeres i et oven i.
MVH
Morten Strårup
#35
34# Et grafikkort til 300 Kr gør vel ikke den store forskel
#36
#23
Proliant kan du slet ikke sammenligne med mainstream pc'er! Efter mine erfaringer så er Proliant serien en kanon stabil computer (har dog kun prøvet Intel versionerne), man bliver meget overrasket over hvor stor forskel platformen kan gøre på hastigheden, når der samtidig er en masse andre brugere af serveren, og man så går hen til den, og den reagere fuldstændig ligeså hurtigt som ens normale workstation, det er sku en fryd! Og uptime tælles i år, og ikke dage 😉
Som jeg skriver, så har jeg kun hørt om Proliant servere, og ikke workstations, så ved ikke hvor velegnet serien er som sådan en?
Men #0 jeg ville nu satse på en dual Xeon... bare for at være anderledes 😉 Men du kan somregel altid være ret sikker på at dit molekyle program, er kompatibel med Intel platformen, og Xeon serien er jo lavet til lige præcis den slags formål...
Proliant kan du slet ikke sammenligne med mainstream pc'er! Efter mine erfaringer så er Proliant serien en kanon stabil computer (har dog kun prøvet Intel versionerne), man bliver meget overrasket over hvor stor forskel platformen kan gøre på hastigheden, når der samtidig er en masse andre brugere af serveren, og man så går hen til den, og den reagere fuldstændig ligeså hurtigt som ens normale workstation, det er sku en fryd! Og uptime tælles i år, og ikke dage 😉
Som jeg skriver, så har jeg kun hørt om Proliant servere, og ikke workstations, så ved ikke hvor velegnet serien er som sådan en?
Men #0 jeg ville nu satse på en dual Xeon... bare for at være anderledes 😉 Men du kan somregel altid være ret sikker på at dit molekyle program, er kompatibel med Intel platformen, og Xeon serien er jo lavet til lige præcis den slags formål...
#37
#0 køb følende
2*A64 Opteron X2(dual core opteron) 4*cpu POWER...
billigt server 2*940 sokkets bundkort med plads til minimum 8 ram sokler og 8gb ram.. helst flere...
4 eller 8*1gb ECC reg ram blocke...
hardiske .. aner det ikke... vel noget scaci/Raptor haloy...
samt en 600-800watts psu til at trække hele svinneri´et med...
og så eventuelt et ATI R 9600/9700/9800 som gfx ... så den kan bruges til lidt andet også... :p
2*A64 Opteron X2(dual core opteron) 4*cpu POWER...
billigt server 2*940 sokkets bundkort med plads til minimum 8 ram sokler og 8gb ram.. helst flere...
4 eller 8*1gb ECC reg ram blocke...
hardiske .. aner det ikke... vel noget scaci/Raptor haloy...
samt en 600-800watts psu til at trække hele svinneri´et med...
og så eventuelt et ATI R 9600/9700/9800 som gfx ... så den kan bruges til lidt andet også... :p
#38
#34
Den skal ikke stå i et serverrum men på et kontor. Ham der skal arebejde på den kommer nok til at sidde nogle timer om dagen forand den, men samtidig skal den virkelig kunne yde noget. Det bliver hovedsagligt et program der hedder Maestro, der har et grafisk interface, men det er et simpelt interface.
Den skal ikke stå i et serverrum men på et kontor. Ham der skal arebejde på den kommer nok til at sidde nogle timer om dagen forand den, men samtidig skal den virkelig kunne yde noget. Det bliver hovedsagligt et program der hedder Maestro, der har et grafisk interface, men det er et simpelt interface.
#39
Som #2 siger, så bør du lave lidt research på den applikation du vil benytte dig af. Jeg har selv kørt nogle små simuleringer af en superheater i et kraftværk, bl.a på en Athlon 64 og en normal P4 uden HT og uden dual channel. Der var naturligvis enorm forskel imellem de to, men programmet vi brugte (Simulink, en byggeblok til Matlab) ved jeg ikke om er multithreaded. Før du går ud og invisterer i en større computer, skal i naturligvis først vide hvad applikationen kan udnytte, samtidig tænke over hvad computeren skal bruges til bagefter - den har jo en vis anvendelsestid. Det kan sagtens være at i ikke kan bruge SMP (symmetric multi processing) til noget i den sammenhæng her. Det er noget i må finde ud af før i køber jeres hardware, hvis i vil tage en fornuftig beslutning.
Mvh. Uffe
Mvh. Uffe
#40
36# Undskylder mange gange :)
37#
Du får ikke meget Dual core Opteron for 20.000Kr
Og alt over ATI Rage/nVidia TNT er overkill til en server
37#
Du får ikke meget Dual core Opteron for 20.000Kr
Og alt over ATI Rage/nVidia TNT er overkill til en server