Det kommer an på chipsettet og SATA controlleren. Nogle chipsets kan bare ikke clocke særligt godt med SATA controlleren aktiv, f.eks. Intel 915 chipsettet, hvor man udelukkende skal have ATA diske tilsluttet hvis man vil overclocke til meget mere end 225-230 Mhz på fsb.
Som andre skriver er det mest et spørgsmål om at /pci/agp/pci-e hastigheder kan "låses" eller ej. Kan de, er der som regel ingen problemer.
På de fleste nyere chipsets er der derfor intet problem i at overclocke med SATA diske. Jeg har ramt 422 Mhz fsb med SATA diske i raid0 på mit bundkort, og det er cpu'en der ikke vil mere.