Forskellen på Socket 939 og AM2, udover den enkelte ekstra pin, ligger i den type ram de kører med.
Som du måske ved sidder ramcontrolleren, på AMD processorer, på processoren. Socket 939 processoren er optimeret til DDR ram og AM2 processoren kører kun med DDR2 ram.
Samtidig er AMD stoppet med at udvikle til Socket 939, så AM2 er fremtiden.(Efter sigende skulle en AM3 processor også passe i AM2, dog med reduceret ydelse)
Mht. dit bundkort burde der ikke være problemer med at du kan putte en X2 i, så længe du får den til den socket.