Jeg kunne godt forestille mig at det er din raid controller der giver problemer. Hvilken version af FreeNAS bruger du? Tjek om det er til den rigtige arkitektur. Evt kan du prøve at pille din raid controller ud og prøve med en enkelt hd igen.
EDIT
Jeg har lige tjekket hvilke controllere der understøttes i AMD64 versionen, og din controller er ikke på liste.
-Zooy